Seta on on johtava sukupuolen ja seksuaalisen suuntautumisen moninaisuuden sekä niihin liittyvien yhdenvertaisuus-, tasa-arvo- ja ihmisoikeusteemojen asiantuntija Suomessa. Seta välittää ajantasaista tietoa sukupuolen ja seksuaalisen suuntautumisen moninaisuudesta, sateenkaari-ihmisten hyvinvoinnin ja oikeuksien toteutumisesta ja niiden edistämisestä kouluttamalla, konsultoimalla sekä osana viestintäänsä.
Setan yhteydessä toimii sukupuolen moninaisuuden osaamiskeskus Transtukipiste. Sateenkaari-ihmisten perhetilanteiden ja -juridiikan asiantuntija on Setan jäsenjärjestö Sateenkaariperheet.
Setan välittämä tieto perustuu tutkimukseen sekä kansainvälisten toimielinten ja kattojärjestöjen konsensukseen siitä, mitä seksuaalisen suuntautumisen ja sukupuolen moninaisuuteen kokonaisvaltaisesti kuuluu, mutta kokemusperäisellä tiedolla on myös merkittävä rooli. Setan asiantuntijuutta vahvistava tutkimustieto koostuu pääosin kansainvälisestä tutkimuksesta, koska suomalaista sateenkaaritutkimusta on vielä hyvin rajoitettu määrä. Setan asiantuntijuuden monipuolisuutta lisäävä kokemustieto on pääosin suomalaista, mikä mahdollistaa kansallisen tason tiedon ja kokemusten hyödyntämisen koulutuksissa ja viestinnässä sekä osana poliittista vaikuttamista.
Seta ei ole laajasti seksuaalisen moninaisuuden asiantuntija, vaan asiantuntijuus kohdentuu selkeästi seksuaaliseen suuntautumiseen. Ihmisoikeusjärjestönä seksuaalinen suuntautuminen nähdään vahvasti myös sosiaalisena identiteettinä, joka on läsnä kaikissa eri elämänkaaren vaiheissa ja elämän eri osa-alueilla.